面团加入酵母菌后，其体积、气味和内部会发生变化，主要原因如下：

食材清单方面：

1. 酵母菌：酵母菌是面团发酵的关键因素。酵母菌是一种真菌，它在面团中生长并繁殖，利用面团的营养成分进行代谢。在发酵过程中，酵母菌会分解面团中的糖类，产生二氧化碳气体和乙醇等物质，这些物质进一步与面团中的其他成分反应，产生一系列的化学变化。

2. 糖：糖是酵母菌的养料，同时也能为面团提供甜味。酵母菌在发酵过程中会分解糖分，产生二氧化碳气体和乙醇，乙醇进一步氧化会形成醋酸和其他物质，这些都会影响面团的口感和风味。

制作步骤方面：

1. 搅拌或揉面：在加入酵母菌前，面团通常需要经过搅拌或揉面等处理步骤，以使面团中的各种成分混合均匀。这个过程中，面团的质地会变得更软、更具有延展性。

2. 发酵：将面团放置在适宜的温度和湿度下，让酵母菌得以生长和繁殖。在这个过程中，酵母菌分解糖分产生二氧化碳气体，使面团膨胀，形成蜂窝状结构。同时，酵母菌也会产生乙醇和醋酸等物质，这些都会改变面团的口感和风味。

3. 烘烤：烘烤过程中，面团中的水分蒸发，面团的体积进一步增大，同时也会形成美味的烘烤色泽。烘烤后，面团的口感也会发生显著变化，例如变得更松软、酥脆等。

因此，面团加入酵母菌后体积、气味和内部发生变化的原因主要包括酵母菌的发酵作用、糖和其他成分的化学反应以及烘烤过程中的物理变化等多个因素的综合作用。