南京大学金陵学院与南京师范大学金陵女子学院的区别是：

1、办学属性不一样：南京大学金陵学院是独立学院，主管部门是江苏省教育厅。南京师范大学金陵女子学院则是公办女子学院，主管部门是南京师范大学。

2、创办时间不一样：南京大学金陵学院的创办时间是1998年。南京师范大学金陵女子学院的创办时间则是1915年。南京师范大学金陵女子学院要比南京大学金陵学院早创办83年。

3、院系不一样：南京大学金陵学院主要有城市与土木工程学院、艺术学院、商学院、外国语学院、化学与生命科学学院等院系。南京师范大学金陵女子学院则是会计与财务管理系、劳动与社会保障系、食品科学与营养系、英语系、女性学系等。

参考资料：

百度百科-南京师范大学金陵女子学院

百度百科-南京大学金陵学院