大使馆只是把材料交到入国管理局,签证是由日本的入国管理局审查的.打电话到日本的入国管理局,说明原因可以查一下.根据你办留学的学校,入国管理局的地点是不同的,电话要具体的查一下.另外你还可打电话到你办留学的学校去查一下,有没有收到过你的审请材料.