南京大学的历史渊源深厚，它与19所高校有着直接或间接的联系。这些高校中不乏像东南大学、电子科技大学这样的重点学府。南京大学在早期发展的过程中，通过各种形式的拆分和重组，孕育出了多所重要的高校。

首先，南京大学的工学院部分院系被拆分重组为南京工学院，后来更名为东南大学。其次，工学院的水利系被拆分后成为河海大学。化工系则被拆分为南京化工学院，之后又经历了多次更名，最终定名为南京工业大学。

南京大学的师范学院则演化成了南京师范大学，农学院则发展成为南京农业大学。其中，农学院的林学系进一步发展成了南京林业大学。

此外，南京大学的气象工程系也经历了变迁，先是从南京大学分离出来成为南京气象学院，后来又更名为南京信息工程大学。

在商学院领域，南京大学的某些院系被拆分后，最终形成了上海财经大学。工学院的航空系则被拆分为华东航空学院，后又发展成为西北工业大学。

医学院的情况比较复杂，南京大学的医学院被拆分重组后，成为第五军医大学，后来又改名为第四军医大学，最终与上海医学院合并，成立了复旦大学医学院。

工学院的食品工程系也被拆分重组，先成为无锡轻工业学院，后又发展成为无锡轻工业大学，最终定名为江南大学。

工学院的农业机械系则被拆分为江苏工学院，后又更名为江苏理工大学，最终定名为江苏大学。

法学院的某些院系被拆分重组，先成为华东政法学院，后来又定名为华东政法大学。

值得一提的是，南京大学还与一些研究机构有着密切的联系，如中科院心理研究所。

另外，金陵大学的影音部被拆分后，成为中央电影学校，后来又发展成为北京电影学院。

同样地，南京大学与中央大学医学院也有着密切的关系。中央大学医学院被拆分后，成为上海医学院，后来又发展成为上海医科大学，最终与复旦大学医学院合并。

工学院的电子工程系也被拆分重组，其中的有线电部分被拆分后，成为成都电讯工程学院，最终定名为电子科技大学。

最后，南京大学还与中央音乐学院有着联系，中央音乐学院是国立中央大学音乐学院拆分重组后的结果。