蛋白质在280nm紫外波段处有强吸收，是因为三种芳香族氨基酸的存在：色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸。分子结构中含有苯环，具有共轭双键，按吸光度排列：色氨酸＞酪氨酸＞苯丙氨酸。

共轭双键越多，吸收波长越大，一个共轭双键大约能增加20nm的波长。