论实力，上海交通大学与南京大学的计算机科学与技术学科均被列为国家重点一级学科，实力强大，相比之下，复旦大学仅有一门国家重点二级学科，似乎略显不足。

按照学术实力排序，上海交通大学、南京大学与复旦大学依次排位。若从学校知名度角度考量，南京大学的声望不及复旦大学，因此在这一维度上排序变为上海交通大学、复旦大学、南京大学。基于此，个人建议直接选择上海交通大学作为首选。