王协康在科研领域取得了显著的成果。作为项目的负责人和主要研究者，他参与了多项关键项目的研究，包括国家自然科学基金、国家攻关、“973”计划及工程生产应用课题，特别是与香港城市大学的深度合作，共同探索非线性科学理论在实际应用中的价值。他们成功申请了香港政府基金（CERG）和香港城市大学战略发展基金（SRG）的资助，这些项目对山区河流水沙运动规律的研究产生了重要影响。他们的研究成果在2002年被四川省科技厅评审，认为达到了国际先进水平，部分成果甚至领先国际，为此荣获了省部级科技进步三等奖。

在教学方面，王协康教授了多门专业课程。最近五年，他主讲了本科生的《水力学》课程，分别在2001年和2005-2006年的两个学期；他还负责了《现代水动力学实验技术》课程，两次面向本科生开课，分别在2005年和2006年；对于研究生，他教授了《泥沙运动力学》、《粘性流体力学》和《相似理论及模型试验》等课程，这些课程为学生们提供了深入理解水利科学理论和技术的基础。