百分之3的税率税金的计算方法如下：

计算3%税率下的税金，需先确认金额是否含税。含税金额的计算方法为税额=含税金额/（1加税率）*税率。以含税金额10000元为例，税额为10000/1.03*3%，结果为291.26元。不含税金额则直接乘以税率，即10000*3%。小规模增值税纳税人应用此计算方式，不得抵扣，税务部门开具的增值税发票亦同。

税金的计算基础：

1、计税金额：税金计算的基数，通常是指货物或服务的价格；

2、税率：按照法律规定或政策确定的税收比例；

3、计算公式：税金=计税金额乘以税率；

4、税种：不同的税种可能有不同的税率和计算方法；

5、扣除项目：在计算税金前，可能需要扣除一些免税额或者减免项目。

综上所述，计算3%税率下的税金，对于含税金额，需通过公式税额=含税金额/（1加税率）*税率来计算，如10000元含税金额对应的税额为291.26元；对于不含税金额，则直接乘以税率，小规模增值税纳税人使用此方法计算税金，且不能进行抵扣，税务部门开具的增值税发票也遵循这一计算规则。

【法律依据】：

《中华人民共和国增值税暂行条例》

第二条

增值税税率：

（一）纳税人销售或者进口货物，除本条第（二）项、第（三）项规定外，税率为17%。

（二）纳税人销售或者进口下列货物，税率为13%：

1.粮食、食用植物油；

2.自来水、暖气、冷气、热水、煤气、石油液化气、天然气、沼气、居民用煤炭制品；

3.图书、报纸、杂志；

4.饲料、化肥、农药、农机、农膜；

5.国务院规定的其他货物。

（三）纳税人出口货物，税率为零；但是，国务院另有规定的除外。