南京二级建造师挂靠费用的确定通常需要建造师与挂靠单位进行协商。费用结构主要包括建造师的工资福利及挂靠单位的服务费用，这两部分的比例各有不同。

建造师的薪酬会根据其专业水平、挂靠单位所在地及挂靠项目的具体情况有所调整。对于经验丰富且技术娴熟的高级建造师而言，他们的薪资待遇通常会更高。

挂靠单位则会对建造师收取服务费，这部分费用会根据挂靠项目的起止时间进行保障。在挂靠项目进行期间的服务费会占据一定比例，而在项目结束后，挂靠单位还会根据建造师在项目中的表现和服务质量收取额外的服务费。

总的来说，南京二级建造师挂靠费用会因挂靠项目的类型不同而有所变化，不同单位的收费标准也各有差异。因此，要想准确确定挂靠费用，就需要深入了解项目的类型以及挂靠单位的具体收费政策。

考虑到不同项目的复杂性，费用也会有所不同。例如，一些大型工程项目可能会涉及到更多的管理与协调工作，因此在服务费上也会有所体现。

此外，挂靠单位还会根据建造师在项目中的具体贡献来调整服务费的收取比例。如果建造师在项目中表现出色，为项目带来了显著的收益，挂靠单位可能会给予更高的薪酬。

因此，建造师在选择挂靠单位时，应充分了解对方的收费标准和服务政策，以确保自己的权益得到保障。

需要注意的是，挂靠费用不仅包括了工资和管理费用，还可能包括一些额外的服务费，如培训费、考核费等。

在选择挂靠单位时，建造师还需要考虑单位的信誉和稳定性，以确保项目的顺利进行。