闽南师范大学的管理结构具有双层隶属特性。从直接管理角度来看，它隶属于教育厅管辖。然而，教育厅作为省级政府的直属机构，使得闽南师范大学在实质上也受到福建省人民政府的间接管理。具体而言，学校的校长由福建省人民政府办公厅进行任命，而党委书记则由省委组织部进行任命。这表明，闽南师范大学在行政体系中同时接受教育厅的专业指导和省政府的总体领导。