专升本校荐和自荐的主要区别在于推荐方式、报考资格获取、志愿填报以及录取方式等方面。

首先，推荐方式不同。校荐生是由所在专科院校根据学生在校期间的综合素质测评成绩进行推荐，可直接获得专升本报考资格。这种方式更为简便，学生无需进行额外的测试或申请。而自荐生则需要自己向意向报考的专升本招生高校进行自荐申请，这通常涉及到提交个人材料、证明以及可能的专业综合能力测试。

其次，在报考资格获得上也有所不同。校荐生只要综合素质测评成绩排名不低于同年级、同专业的一定比例，就可以直接获得专升本报考资格。自荐生则需要通过招生高校的专业综合能力测试，才能获得报考该校的资格，这相对增加了难度和不确定性。

再者，志愿填报时两者也存在差异。校荐生由于已经获得了推荐资格，因此可以填报所报专业内的任何高校，选择范围更广。而自荐生则只能填报获得自荐资格的高校和相关专业，选择范围相对较窄。

最后，在录取方式上，虽然具体政策可能因地区和院校而异，但一般来说，校荐生会按照正常的录取程序进行录取，即综合考虑考试成绩、综合素质评价等因素进行择优录取。自荐生的录取方式则可能更加灵活，但通常也会参考考试成绩和其他相关因素。

总的来说，校荐和自荐在专升本过程中各有优势。校荐生通常能够更直接地获得报考资格，并在志愿填报时拥有更多选择；而自荐生则需要通过自身努力通过专业综合能力测试，获得报考资格。在选择哪种方式时，学生应根据自身情况和目标院校的招生政策进行综合考虑。