以运输为主要业务的公司，其运费收入在会计处理时应按照主营业务收入进行核算。具体而言，当运费收入到账时，应当记录在银行存款（或库存现金、应收账款等科目）。同时，贷方应分别记入“主营业务收入”和“应交税费---应交增值税（销项税额）”科目。

例如，一家物流公司收到一笔运费收入，这笔收入应按照主营业务收入的原则处理。首先，在会计分录中，借方应记录在“银行存款”科目，贷方则分别记录在“主营业务收入”和“应交税费---应交增值税（销项税额）”科目。

而对于那些不以运输为主要业务的公司，其运费收入则应作为其他业务收入进行核算。具体而言，当运费收入到账时，应当记录在银行存款（或库存现金、其他应收款等科目）。同时，贷方应分别记入“其他业务收入”和“应交税费---应交增值税（销项税额）”科目。

例如，一家制造企业偶尔会为客户提供运输服务并收取运费，这笔收入应按照其他业务收入的原则处理。在会计分录中，借方应记录在“银行存款”或“其他应收款”科目，贷方则分别记录在“其他业务收入”和“应交税费---应交增值税（销项税额）”科目。

不论是主营业务收入还是其他业务收入，运费收入都应通过应交税费科目来反映其对应的增值税销项税额。这一处理方式有助于准确反映公司的经营状况和财务状况，为税务申报和财务分析提供依据。