1. 农村电子商务通过电子化、数字化传统的商务流程，既减少了人力和物力成本，又突破了时间和空间的限制，使得交易活动不再受限于特定时间和地点，从而显著提升了效率。

2. 农业网络基础设施薄弱，缺乏区域性战略布局。尽管目前有许多提供农业电子商务服务的网站，但由于农村地区软硬件资源的不足，以及网络接入农户的“最后一公里”难题，农民难以直接有效地参与电子商务。此外，中国广阔的地理面积和巨大的区域差异，以及农业的区域性特征，使得农村电子商务的问题更加复杂。因此，农业电子商务的发展必须考虑各区域的独特性，以便更好地推进。

3. 农产品需求的不可预知性是农村电子商务面临的挑战之一。由于自然条件的影响，农产品的生产和农用品的需求都存在很大的不确定性。农产品生产者和生产区域相对分散，附加值较低，产品不易储存，种类繁多且品质评价主观性强，这些因素都严重阻碍了农产品生产产业化及流通现代化，成为实现农村电子商务的难点。

4. 农村电子商务的覆盖面较窄，仍处于萌芽阶段。目前，我国的农村电子商务正在成长期。东部地区的电子商务发展已初具规模，而西部偏远山区的电子商务则仍处于初步发展阶段。在偏远山区，互联网的覆盖面仍然有限，这限制了农村电子商务的普及和发展。