主要有水资源保护，水利工程对环境的影响，流域或区域治理开发的环境问题等。 水利工程对环境影响研究的目的在于发挥工程的综合效益，消除或减少不利于环境的影响。有些国家很早就开始此项研究。20世纪30年代美国田纳西河治理就考虑到杀灭疟蚊的工程调度方式。许多国家在修建拦河闸坝时早已注意设置过鱼设施。但全面研究工程的环境影响问题，是近几十年水利建设规模逐渐扩大后才受到重视。1969年美国最先把工程的环境影响评价定为制度。70年代国际上有许多学者和团体提出了一些评价方法，并在实践中得到不断发展。中国从70年代末已开始对已建水利工程进行环境影响回顾评价，80年代初并规定新建工程都要先期做好环境影响评价。