健全预算绩效管理制度的方法：

一、完善预算绩效管理体系

1. 构建全面覆盖的预算绩效管理框架。 包括预算的编制、执行、监督、评价等各个环节，确保各项经济活动都纳入绩效管理范畴。

2. 细化绩效目标。 设定具体、可衡量的绩效指标，确保预算目标与实际业务需求相匹配，提高预算的针对性和有效性。

二、强化预算执行的监控和评估

1. 加强预算执行的过程控制。 建立预算执行监控机制，定期跟踪预算执行情况，确保预算按计划执行。

2. 完善预算绩效评估体系。 对预算执行结果进行全面评估，分析偏差原因，为优化预算提供决策依据。

三、推进预算绩效管理的信息化建设

1. 利用现代信息技术手段。 通过信息化手段提高预算管理效率，确保数据准确性和实时性。

2. 建立预算绩效管理系统。 实现预算数据的自动处理和分析，提高预算决策的科学性和准确性。

四、加强人才队伍建设

1. 培养专业人才。 加强预算绩效管理方面的专业培训，提高相关人员的专业素养和技能水平。

2. 引进外部专家。 聘请具有丰富经验和专业知识的外部专家，为预算绩效管理制度的健全提供智力支持。

健全预算绩效管理制度是提升组织财务管理水平的关键举措。通过完善预算绩效管理体系、强化预算执行的监控和评估、推进信息化建设和加强人才队伍建设，可以有效提高预算的效率和效果，促进组织的可持续发展。其中，构建全面覆盖的预算绩效管理框架、加强预算执行的过程控制和绩效评估，以及利用现代信息技术手段和加强人才培养，是健全预算绩效管理制度的重要方面。