持有香港身份的学生在申请中国大陆的顶尖学府时，比如清华大学和北京大学，确实具备一定的优势。这些优势主要体现在以下几个方面。

首先，录取机会。相对于其他考生而言，持有香港身份的学生在参加清北等高校的录取时，拥有较高的录取概率。这是因为港澳台联考的难度相对较低，且港澳台地区的考生在高考的竞争中通常处于较轻的负担状态。

其次，费用优惠。持有香港身份的学生在申请清北等高校时，能够享受到一定的费用优惠措施，如学费减免、住宿费减免等。这无疑减轻了他们的经济负担，使他们能够更专注于学术和生活。

再次，就业优势。对于持有香港身份的学生而言，毕业后选择在大陆工作时，办理相关就业手续将更加便捷，从而获得更多的就业机会。尽管持有香港身份的学生在申请清北等高校时仍需满足相应的招生要求，如高考成绩和学科要求，但这并不能保证一定被录取。

综上所述，持有香港身份的学生在申请清北等中国大陆顶尖学府时，确实存在一些优势，但同时仍需满足相关入学条件。在享受这些优势的同时，学生也应努力提高自身实力，以提高录取成功率。