申请三个月或一年多次商务签注，需遵循以下步骤。首先，通过网上预约并审核通过后，在预约的有效期内，携预约信息表上的材料至指定窗口办理。对于本市居民，首次申请、换发、补发港澳通行证，本人必须到场办理。如需再次申请签注，可委托他人办理，但代办人需提交身份证。对于外省市居民，首次申请、换发、补发港澳通行证及再次申请签注时，必须本人亲自到场。

若错过预约时间，视为放弃此次申请，需重新进行网上预约。对于申请新的签注，必须注销同一目的地的原有有效签注。特别提醒，申请办理澳门三个月多次商务签注时，除了办理登记备案手续外，还要求在申请日前一年内，办理过3次三个月一次澳门商务签注并均具有良好的出入境记录。对于持有三年期以上人才类居住证的人员，则可以直接申请澳门三个月多次商务签注。