土木工程作为应用广泛的专业，各大理工科大学均设有此专业，且作为重点大系存在。作为国家“211工程”的一部分，这些大学自然不会忽视土木工程系的建设。在南京这片教育沃土上，土木工程系的优质院校繁多。其中，东南大学作为顶尖的985大学，土木工程系享誉全国。而在211工程大学中，南京航空航天大学、南京理工大学、河海大学、南京农业大学等院校的土木工程系也颇受好评。南京工业大学作为江苏省的重点院校之一，其土木工程系同样实力不俗，培养出了大批优秀人才。