抗原一旦侵入宿主细胞内部，体液中的抗体就不能与这些抗原直接发生特异性性结合了，这时候就需要通过细胞免疫来消灭和清除这些抗原。

先经过吞噬细胞的摄取和处理然后呈递给T细胞，T细胞接受抗原刺激后，开始进行一系列的增殖分化形成效应T细胞，而一部分形成记忆细胞（当同一种抗原再次进入及提示，记忆细胞就会迅速增殖分化形成大量的效应T细胞）

效应T细胞与被抗原入侵的宿主细胞密切接触时，激活宿主细胞内的溶酶体，使宿主细胞的通透性改变，渗透压发生变化，最终导致宿主细胞裂解死亡。细胞内的抗原也因失去藏身之所而被抗体消灭。

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