会计电算化在企业运用中存在多方面的问题。其中，财务预算的规划与管理环节相对薄弱，导致企业在财务预测和资源配置上存在不确定性。财务改革的推进也相对缓慢，未能有效推动会计电算化的深入应用。

为了解决上述问题，我们需要从系统层面进行优化。系统开发人员应深入理解企业财务流程，针对每个模块的功能进行更加完善的设置。此外，强化系统与企业内部其他业务系统的集成，实现信息的无缝对接，提高财务数据的准确性和时效性。

同时，企业应加大对会计电算化的培训力度，提高财务人员对电算化系统的操作熟练度和理解深度。通过培训，财务人员能够更高效地利用电算化系统进行财务分析、报表编制等工作，提升财务工作效率。

另外，企业应建立健全的内控机制，确保会计电算化的安全性和合规性。这包括设置权限管理、数据备份与恢复、以及定期的安全审计等措施，以防止数据丢失和非法访问，确保财务信息的安全。

综上所述，通过系统优化、培训提升和内控机制的完善，会计电算化在企业运用中的问题可以得到有效的解决。企业应积极采取措施，推动会计电算化的深入应用，实现财务管理的现代化、高效化和智能化。