清朝时期，地方行政区划主要采取省、府（直隶州、直隶厅）、县（散州、散厅）的三级制度。初期，全国共划分为18行省。顺治年间，北京被设为顺天府，由府尹掌管京畿地区事务。雍正元年（1723年）起，由六部尚书、侍郎内选任的大臣兼管府尹事。乾隆八年（1743年），顺天府下辖24州县，分为四路厅管理，分别是西路厅、东路厅、南路厅和北路厅。

西路厅包括琢州及大兴、宛平、良乡、房山四县；东路厅包括通州、蓟州及三河、武清、宝坻、宁河、香河五县；南路厅包括霸州及保定、文安、大城、固安、永清、东安六县；北路厅包括昌平州及顺义、怀柔、密云、平谷四县。各路厅设有同知，分管州县事务，同知还兼管捕盗、钱粮、刑名案件等。

顺天府设有府丞、治中、通判、经历、照磨、司狱等官职，分掌不同事务。府学教授和训导负责教育事务，府学还负责保管书籍和文庙祭器。州县除直隶两京县外，其余均需向顺天府及直隶总督查核汇报。

奉天府设立于顺治十四年（1657年），原为辽阳府，后改为奉天府，由府尹掌管盛京地区事务。乾隆二十七年（1762年），盛京将军开始节制该地区。至光绪年间，奉天府下辖五府、四厅、六州、二十六县。

五府包括锦州府、昌图府、新民府、海龙府、兆南府；四厅为凤凰直隶厅、兴京厅、金州厅、营口厅；六州为辽阳州、复州、宁远州、义州、岫岩州、辽原州；二十六县包括承德县、兴仁县、海城县、盖平县、开原县、铁岭县、镇安县、彰武县、东平县、西丰县、西安县、柳河县、锦县、绥中县、广宁县、怀德县、奉化县、康平县、段乎册安东县、宽甸县、通化县、临江县、怀仁县、缉安县、靖安县、开通县。

奉天府的官僚机构与顺天府相似，负责管理地方事务。