本科线和本科特殊招生线的主要区别在于定义和适用范围。

一、定义不同

1. 本科线：也被称为本科最低录取控制分数线，是指考生在高考中成绩达到该分数线以上，才有可能被本科高校录取。这是划定本科和专科的分数线，主要基于全体考生的整体成绩进行划定。

2. 本科特殊招生线：主要是为了适应高考改革和高校选拔特殊人才的需求而设定的。这条线主要针对一些特定的招生计划，如自主招生、综合评价招生等。考生的高考成绩不仅要达到本科线以上，还需要满足特殊招生的特定条件，才能被相应高校录取。

二、适用范围不同

1. 本科线适用于所有参加高考的考生，只要成绩达到本科线，就有可能被本科高校录取。

2. 本科特殊招生线的适用范围相对有限，主要针对特定的招生计划和高校。考生需要满足特定的条件和要求，才能被相应的高校录取。

三、详细解释

本科线是一个基础分数线，决定了考生是否有资格被本科高校录取。而本科特殊招生线则是在此基础上进一步筛选特殊人才的门槛。随着高考改革的深入，高校对特殊人才的需求越来越大，因此设立了本科特殊招生线。这不仅有利于高校选拔到更优秀的人才，也有利于促进高考多元化评价体系的建立。考生在选择报考高校和计划时，需要了解并清楚自己的成绩是否达到相应的要求，以便做出更合适的选择。