合聚咖

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怎么分析一个基因的稀有密码子

admin

恩,,说一下原理。首先就是你要有表达载体的遗传密码表(大肠杆菌、赤毕酵母之类的),接着你要得到你序列的密码子使用频率,最后把这两个表进行一个对比,就可以得到基因中的稀有密码子。

具体的内部操作:找到一个使用最多的密码子,把这个密码子的分值定为1,然后以这个为标准,其他的密码子进行打分(因为使用频率最多的分值为1,所以其它的分值都是小于1的,比如0.8,0.7之类的)。最后对比分值,得分低的就是稀有密码子。当然这个不用自己做,现在有现成的在线稀有密码子分析工具,你直接把序列输进去就可以得到答案了。