南京大学。

1、全国排名对比。南京大学全国排名第8位，仅次于中国科学技术大学；江苏省内排行第1名；全国综合类高校排名第8名，仅次于中国科学技术大学。同济大学全国排名第14位，仅次于哈尔滨工业大学；上海市内排行第3名，仅次于复旦大学；全国综合类高校排名第13名，仅次于中山大学。

2、学科实力对比。南京大学一共41个学科上榜，其中综合实力最强的专业学科有：A+类学科3个（天文学、地质学、图书情报与档案管理）、A类学科11个（哲学、社会学、中国语言文学、外国语言文学、中国史、物理学、生物学、计算机科学与技术、环境科学与工程、软件工程、工商管理）、A-类学科7个（理论经济学、法学、数学、地理学、化学、生态学、电子科学与技术）。同济大学一共44个学科上榜，其中综合实力最强的专业学科有：A+类学科4个（土木工程、环境科学与工程、城乡规划学、管理科学与工程）、A类学科1个（设计学）、A-类学科7个（数学、机械工程、计算机科学与技术、建筑学、交通运输工程、风景园林学、软件工程）。