深圳的大学研究院主要包括：深圳大学、南方科技大学、深圳技术大学等研究院。

一、深圳大学研究院

深圳大学是深圳市的一所综合性研究型大学，其研究院涵盖了多个学科领域，包括工程技术、生物医学、新材料等。这些研究院在新能源、互联网等战略性新兴产业中扮演重要角色，积极开展产学研合作，推动科研成果的转化和应用。

二、南方科技大学研究院

南方科技大学作为深圳市的一所创新型高校，其研究院在自然科学和工程技术领域具有较高的研究水平。该院致力于前沿科技的探索，并拥有一批高水平的研究团队和科研项目。同时，南方科技大学还与多个企业建立了合作关系，推动科技成果的商业化应用。

三、深圳技术大学研究院

深圳技术大学以应用技术教育为主，其研究院在工程技术领域具有较强的研究实力。该院注重与企业合作，开展技术研究和人才培养，致力于解决行业中的实际问题。深圳技术大学的研究成果在国内外具有较高的影响力，为推动地方经济社会发展做出了重要贡献。

除了以上几所高校的独立研究院之外，深圳市还有其他交叉学科、跨学科的研究机构或实验室。这些研究机构不仅在基础研究方面取得显著成果，还在推动产学研合作和科技成果转化方面发挥了积极作用。