南京工程学院作为一所工学为主的高等工程应用型本科院校，其学科专业广泛，包括工学、经济学、管理学、文学、理学、法学等六大领域。其中，机械工程学院、材料工程学院、能源与动力工程学院等学院在工学领域发挥着重要作用，为学生提供了丰富的学习资源和实践机会。此外，经济与管理学院、建筑工程学院、艺术与设计学院、计算机工程学院、自动化学院、通信工程学院等院系则涵盖了经济、管理、建筑、艺术设计、信息科技等多个方面，旨在培养具备跨学科知识和技能的复合型人才。

南京工程学院还设有汽车与轨道交通学院、环境工程学院、人文与社会科学学院、外国语学院以及马克思主义学院，这些学院进一步丰富了学校的学科结构，提供了多样化的教育路径。其中，人文与社会科学学院专注于培养学生的社会人文素养，而外国语学院则致力于提高学生的语言能力和跨文化交际能力，助力学生在全球化背景下更好地适应社会。

南京工程学院注重实践教学，为学生提供了丰富的实践机会。机械工程学院和材料工程学院通过与企业的合作，为学生提供了实习和实训的机会，帮助他们将理论知识与实践相结合。能源与动力工程学院、电力工程学院则通过实验课程和项目研究，让学生在实际操作中掌握专业知识。

南京工程学院的学科设置不仅涵盖了工程技术领域，还涉及经济管理、人文社会科学等多个方面，为学生提供了多元化的学习和发展路径。学校通过多样化的院系设置和实践教学，致力于培养具有创新能力和实践能力的复合型人才，以满足社会对高素质人才的需求。