信息科学技术学院位于厦门大学的本部，即思明校区。

厦门大学在翔安校区设有九个学院，具体为：生命科学学院、海洋与地球学院、环境与生态学院、医学院、药学院、公共卫生学院和能源学院，国际学院以及海外教育学院。这些学院均坐落在翔安校区。

而除了翔安校区的九个学院外，厦门大学的其他学院都在思明校区内就读。嘉庚学院的学生则在厦门大学的漳州校区进行学习。