南京拥有多所知名一本大学，总数达22所，其中南京大学与东南大学是位居前列的双一流建设高校。南京师范大学、南京农业大学、南京理工大学、中国药科大学、南京航空航天大学、河海大学等六所是211大学的代表。南京邮电大学、南京信息工程大学、南京中医药大学、南京林业大学等四所则被认为是双一流建设学科高校。除此之外，还有十所其他公立本科院校。南京的一本大学名单整理如下，按学校代码排序，而非排名（以下名单）。