根据教育部的国家重点学科评判，复旦大学的物理学科表现优异。在理论物理领域，复旦大学与北京大学、北京师范大学、南京大学和中国科学技术大学并列。粒子物理与原子核物理方面，北京大学、清华大学、中国科学技术大学和兰州大学占据领先地位。原子与分子物理的研究中，清华大学、吉林大学和四川大学是主要力量。等离子体物理方面，大连理工大学和中国科学技术大学表现突出。凝聚态物理领域，北京大学、清华大学、吉林大学、复旦大学、上海交通大学、南京大学、中国科学技术大学、山东大学、郑州大学和中山大学都有不错的表现。

此外，在声学研究方面，南京大学处于领先地位。光学领域，北京大学、北京工业大学、山西大学、哈尔滨工业大学、复旦大学、中国科学技术大学和华南师范大学都有一定的研究实力。无线电物理方面，南京大学和武汉大学的研究工作也值得关注。从整体来看，复旦大学的物理学科无论是在基础理论研究还是应用技术开发方面都展现了较强的竞争力。

虽然上海交通大学在某些领域如凝聚态物理和无线电物理也有一定实力，但在总体评价中，复旦大学在物理学科的多个分支领域展现出了更为全面和强大的研究能力，因此在物理学科的评价中占据优势地位。

不过，具体选择哪所学校还需要根据个人兴趣和职业规划来决定。上海交通大学和复旦大学都在物理领域有着深厚的学术积淀和丰富的研究资源，两所学校都值得学生们深入探索。