行政指令方法作为管理手段，其运用需遵循特定原则以确保其效能。首要原则是调查研究在先，即上级在下达命令或指示前，需对下级情况有深入了解，包括思想动态、工作环境与条件变化等。这确保指令更具针对性，避免主观臆断的错误指挥。

其次，坚持具体指导原则至关重要。上级不应下达命令后即告结束，而应提供具体指导，鼓励下级结合实际情况，灵活创造性地执行命令。这既保证了指令的灵活性，也激发了下级的主动性和创新性。

最后，强调思想政治工作领先。运用行政指令方法时，有效开展思想政治工作能增进下级对上级意图的理解，增强执行指令的自觉性和有效性。同时，通过加强思想政治工作，可促进上下级关系和谐，保障行政渠道畅通无阻，为指令的传达与执行提供良好环境。