根据《国家教育委员会、国家计划委员会、财政部关于印发〈高等学校培养第二学士学位生的试行办法〉》（（87）教计字105号）的精神，双学位与第二学士学位之间存在一些明显的区别。首先，报考条件不同。第二学士学位主要面向已经获得学士学位的在职人员，包括那些在学位制度实施前已毕业的学生。此外，它也允许少量的应届毕业生报考，特别是那些按照学分制提前完成学业并获得学士学位的学生。在职报考者必须经过单位的批准，并通过必要的资格审查、入学考试和考核，最终择优录取。第二学士学位的修业年限通常为两年，某些专业，如中医学，可能需要三年。

相比之下，双学位的招生对象则更为严格，仅限于全日制在校本科学生，并且他们可以在未取得第一学位的情况下跨专业选择第二学位课程。通过成人高考或自学考试获得本科学历的人，则不符合报考第二学士学位的条件。如果想要报考第二学士学位，考生必须参加国家学位办组织的学士学位考试，获得学士学位后，方可报名参加第二学士学位的考试。

审批权限方面，双学位由学校自行制定并批准，而第二学士学位则需要教育部审批。只有获得教育部批准设置第二学士学位专业的高校才有权颁发第二学士学位证书。

在发证方面，双学位的毕业证和学位证会在一个证件上同时标注两个专业或学位名称，而第二学士学位则会分别颁发毕业证书和学位证书。

最后，关于毕业待遇的规定也有所不同。国家对双学位毕业生的待遇没有明确规定，而对第二学士学位毕业生则明文规定，获得该学位者，其毕业后所获得的起点工资与研究生班毕业生相同。