江苏科技大学在镇江有东西南三个校区，在张家港有一个校区，其中镇江的东校区为本部。

第一年入学的本一新生都在西校区;本二中理工科在西校区，文科在张家港校区;本三都在南校区，中外合作办学的学生在东校区，研究生也在东校区。

第二年，在西校区如船舶与海洋工程专业等理工科的学生转至东校区，其余文科专业均不转。

本三部分理工类专业于大四转至东校区。