从国科大首届毕业生到2021届的就业情况来看，深造率都在90%以上。2021届深造率超过93%，深造率全国第一。

由于国科大本科招生年限较短，每年招生人数不多，且本科毕业生大多选择深造，所以官网并没有详细的就业质量报告，但从官方公布的数据可以看出，只要考上这所学校，相当于是半个研究生了。

统计显示，2019届本科毕业生共270人继续深造，其中68人境外深造，202人在境内深造，继续深造率约占毕业人数的87.95%。