平行志愿的投档比例因省份和年份的不同而有所变化，但通常来说，平行志愿的投档比例一般为100%，即按照招生计划数进行投档，不进行超额投档。在某些情况下，如果院校调档比例为105%，那么存在5%的退档风险。如果院校在招生章程中承诺“当考生所填报的所有专业不能满足时，服从专业调剂，身体合格，符合录取条件，进档不退档”，则考生即使填了服从专业调剂，也不会被退档。但如果院校没有这种承诺，即使填了服从专业调剂，因无计划无法调剂时，多余的比例会被退档。

此外，平行志愿的投档原则是“分数优先、遵循志愿、一轮投档”，即先从最高分考生开始，依次检索和投档，当轮到检索某一考生时，遵循该考生所填报的志愿顺序检索，当符合投档条件且院校有计划余额时，即被投档。在平行志愿模式下，不存在同分考生，对于高考总成绩相同的考生，会采取将单科成绩按一定顺序排列追加在总分后面，以小数位来区分名次的办法。

在广东省，2024年的平行志愿投档也是以院校专业组为投档单位，按照“分数优先、遵循志愿”的原则进行投档，且投档后，其他所填报的院校专业组无效。如果考生档案投档到某院校专业组后，因故被退出，将不再补投到该批次平行志愿的其他院校专业组。