根据您的描述，您持有的证书似乎是由不同的机构颁发。首先，您提到了一张纸张证书，这通常是由教育部考试中心颁发的全国计算机等级考试二级证书。这样的证书在教育系统内具有一定的认可度。

然而，您还提到了另一个证书，由“全国高等学校非计算机专业计算机联合考试福建省考区”颁发，这是一个小本证书，标记为“cct全国高等学校计算机考试证书”。这个证书的含金量可能相对较低，因为它是由专门针对非计算机专业的学生进行的考试机构颁发的。

总结来说，您持有的证书中，教育部考试中心颁发的全国计算机等级考试二级证书可能在更多领域内被广泛认可，而“全国高等学校非计算机专业计算机联合考试福建省考区”颁发的证书可能在专业领域内的认可度相对较低。在职业发展或教育晋升时，建议考虑使用由教育部考试中心颁发的证书，因为它更可能被广泛接受。

请注意，具体证书的价值和认可度可能会因地区、行业和雇主的不同而有所差异，建议您在求职、升学等情境下，根据具体情况进行选择和准备。