交通部的造价工程师与建设部的造价工程师在专业领域上有所侧重，但总体上并无实质性的区别。交通部的造价工程师主要关注公路隧道造价工程，而建设部的造价工程师则更侧重于建筑和市政项目的造价管理。虽然两者在某些方面存在差异，但最终的归口管理还是归于建设部。

从考试难度上看，建设部的造价工程师考试被认为比交通部的更加严格。由于行业特性的不同，交通部的造价工程师证书主要应用于公路水运工程项目，要求必须加盖交通部的职业资格章。而建设部的造价工程师证书则不被交通部所承认。

这种差异也类似于监理工程师的考试和应用。交通部的监理工程师证书主要应用于公路工程项目，而建设部的监理工程师证书则主要应用于建筑和市政工程项目。因此，交通部的造价工程师证书和建设部的造价工程师证书之间无法互相通用。

总的来说，无论是建设部的造价工程师还是交通部的造价工程师，它们在各自的领域内都有着重要的作用，但因为行业特性的不同，导致了它们在证书的通用性和应用范围上的差异。