在上海市，华东师范大学的地理系被认为是最优秀的。交大的地理专业则排名在华师大之后。

上海交通大学的强势专业包括信息安全和物理等。从整体实力来看，交大的师资力量等各个方面都较为出色。因此，对于选择地理专业而言，首选应该是华东师范大学，其次再考虑上海交通大学。

华东师范大学的地理系拥有优秀的教师团队和丰富的研究资源，其毕业生在就业市场上也具有较高的竞争力。相比之下，虽然上海交通大学在某些领域具有显著优势，但在地理学方面，其专业实力可能稍逊一筹。

值得注意的是，不同学生的需求和兴趣不同，选择学校和专业时应综合考虑个人兴趣、职业规划以及学校的实际情况。无论选择华东师范大学还是上海交通大学，关键在于能否充分利用资源，发挥个人潜力。

总体来说，华东师范大学的地理系在上海市内具有较高的声誉和较强的竞争力，但在选择时也应考虑到上海交通大学在其他领域的优势，做出最适合自己的选择。