自考本科软件工程课程设置较为全面，涵盖了多方面的专业知识。主要科目包括中国近现代史纲要、马克思主义基本原理概论、英语(二)、计算机网络技术（证书课程）、软件工程、软件工程（实践）、网络应用程序设计（实践）、网络应用程序设计、软件测试技术、软件项目管理、高级数据库技术（证书课程）、高级数据库技术（实践）（证书课程）、多媒体计算机技术、多媒体计算机技术（实践）、软件开发工具与环境、软件开发工具与环境（实践）、信息安全。对于不考英语二的学生，需要额外参加概率论与数理统计（二）、面向对象程序设计、面向对象程序设计（实践）、离散数学（二）的学习。这些课程旨在培养学生的软件开发、网络应用、项目管理和信息安全等多方面的技能。

中国近现代史纲要和马克思主义基本原理概论等课程有助于学生了解国家发展和社会进步的历史背景，强化思想理论基础。英语(二)则是为了提高学生的英语水平，有助于日后的工作和国际交流。计算机网络技术、软件工程、软件工程（实践）等课程则重点培养学生的编程和软件开发能力。网络应用程序设计、软件测试技术、软件项目管理等课程则侧重于提高学生在软件开发过程中的实际操作能力，从需求分析到项目管理，全面覆盖。

此外，高级数据库技术（证书课程）、高级数据库技术（实践）（证书课程）和多媒体计算机技术、多媒体计算机技术（实践）等课程则侧重于数据管理和多媒体技术的应用。软件开发工具与环境、软件开发工具与环境（实践）等课程则帮助学生掌握最新的开发工具和环境。信息安全课程则强调保护数据安全的重要性。

自考软件工程专业的学生需要完成毕业设计，这是对所学知识的一次全面检验。整个学习过程中，学生将通过理论学习和实践操作相结合的方式，全面提升自己的软件工程能力。