自考本科生在考研时确实存在一定的限制。首先，依据《全国硕士研究生招生工作管理办法》，我国考研制度允许自考本科生跨专业报考研究生，没有明确禁止这一行为。不过，需注意，并非所有高校和专业都接纳跨专业考研的学生。某些专业可能会对考生的前置课程或其他资质有所要求，特别是对那些专业性强或需特定技能的专业。此外，如考生计划跨专业报考医学类、法律类等专业，可能需要额外准备相关资格考试或提交额外证明材料。