物流发票进项计入“应交税费--应交增值税”科目。

详细解释如下：

1. 物流发票进项的含义：物流发票是物流服务公司提供的服务发票，而进项是指购进货物或接受服务所支付的税额，这部分税额可以作为企业应缴纳的增值税的抵扣。当企业支付物流费用，并取得相应的物流发票后，其中所支付的物流费用中含有的税额即构成企业的进项税额。

2. 会计科目的选择：根据会计准则，企业在购进货物或接受服务时支付的税额应记入“应交税费”科目下的相应子科目。具体到物流发票的进项，应计入“应交税费--应交增值税”科目。这意味着企业可以在一定范围内用这部分税额来抵扣其销售货物时产生的销项税。

3. 税务处理的重要性：正确的税务处理对于企业财务管理至关重要。企业必须确保其账务记录准确反映了每一笔交易的税务情况，以便在税务审计时能够合规应对。因此，在收到物流发票并支付相关费用时，企业应及时将物流发票的进项记入相应的会计科目，确保税务处理的准确性和合规性。

4. 注意事项：企业在处理物流发票进项时，还需注意发票的真实性和合法性，确保取得的发票是有效的税务凭证，避免因发票问题造成税务风险。此外，企业还应关注相关税收政策的变化，以确保税务处理符合最新的法规要求。