杭州南站到杭州站地铁乘坐地铁5号线。根据百度地图显示，杭州南站到杭州站地铁路线如下：

1、在杭州南站乘坐地铁5号线，经过13站，到达城站。

2、步行约270米，即可到达杭州站坐地铁。杭州南站（HangzhounanRailwayStation），位于中国浙江省杭州市萧山区境内，是中国铁路上海局集团有限公司管辖的一座铁路车站，是杭州钱塘江南岸的一座客运火车站，也是杭州铁路枢纽的主要客运站之一。