毛细管电泳的分离模式多样，主要根据其类型和操作方式进行划分。
1. 分离模式类型
毛细管电泳包括单根毛细管的区带电泳（CZE，毛细管和电极槽中填充相同缓冲液），如毛细管等速电泳(CITP，两种不同缓冲液的运用)，毛细管等电聚焦(CIEF，管内有pH梯度介质)，胶束电动毛细管色谱(MECC，CZE缓冲液中加入胶束)，微乳液毛细管电动色谱(MEEKC，水包油乳液高分子离子交换)，毛细管电动色谱(PICEC，微观分相高分子离子)等。还有开管毛细管电色谱(OTCEC，固定相涂层，分正反离子交换)和亲和毛细管电泳(ACE，亲和试剂的加入)。
单根填充管则有毛细管凝胶电泳(CGE，填充凝胶介质，如聚丙烯酰胺或琼脂糖)，以及填充毛细管电色谱(PCCEC，色谱填料离子交换)。阵列毛细管电泳(CAE)利用多根毛细管，而芯片式毛细管电泳(CCE)则利用载玻片上的微通道进行操作。
联用技术，如毛细管电泳与质谱(CE/MS)和核磁共振(CE/NMR)，分别采用电喷雾接口和停顿式扫描方法，毛细管电泳与激光诱导荧光(CE/LIF)则具有单细胞和单分子分析的潜力。
2. 操作方式
根据操作方式，毛细管电泳可分为手动、半自动和全自动型，提供不同程度的自动化程度。
3. 分离通道形状
通道形状各异，有圆形、扁形和方形等，这影响了样品的流动路径和分离效果。
4. 缓冲液介质
按缓冲液介质，可分为水相毛细管电泳(CE)和非水毛细管电泳(NACE)。NACE采用有机溶剂，增强了疏水性物质的溶解度，适用于在水中难以分离的化合物。
扩展资料
毛细管电泳（capillary electrophoresis，CE）又称高效毛细管电泳（high performance capillary electrophoresis，HPCE），是一类以毛细管为分离通道、以高压直流电场为驱动力的新型液相分离技术。毛细管电泳实际上包含电泳、色谱及其交叉内容，它使分析化学得以从微升水平进入纳升水平，并使单细胞分析，乃至单分子分析成为可能。长期困扰我们的生物大分子如蛋白质的分离分析也因此有了新的转机。
