在建筑工程施工过程中，资料整理的费用收取方式多样。对于大型工地，收费通常按平方计算，大约10万平方的建筑，每平方收费在3元到2元之间。而对于小型工地，收费则采取一次性支付的方式，比如一个仅1000平方的工地，可以一次性收取7万到10万的费用。当然，这还需要考虑工作量，比如你只需在项目竣工时完成竣工资料的整理，这种情况下一次性收费可能在2万到3万之间，主要费用由他们承担。

此外，资料整理的费用还会根据具体内容的不同而有所变化。如果只是提供资料整理服务，那么费用相对较低；但如果包括安全资料的整理，费用就会更高一些。值得注意的是，这里的承包是指部分承包，而非全部。

在与客户协商费用时，可以根据项目的具体情况灵活调整。比如，客户可以提供纸张等材料，这样可以降低你的成本，从而在报价上更具竞争力。同时，也要根据自己的工作效率和质量要求，合理设定费用标准。

总的来说，资料整理服务的收费不仅取决于项目规模和具体内容，还与双方的合作方式和工作量密切相关。在实际操作中，双方需要充分沟通，找到一个双方都能接受的价格。