应届“少数民族骨干计划”研究生毕业后，根据定向协议，“必须回到定向省、自治区、直辖市和州就业。”定向省、自治区、直辖市教育行政部门只提供就业指导。如果违约，则按定向协议相关条款执行。

计划从2006年起用五年时间为西部培养一批少数民族高学历专业人才，培养学校为双一流以上重点大学，生源为西部省市区。按照“定向招生、定向培养、定向就业”的要求，采取“统一考试、适当降分”等特殊政策措施招收新生。

毕业生一律按定向培养和就业协议到定向地区和单位就业，硕士服务期限为5年，博士8年。经费享受中央级高校研究生的拨款政策。

人事部负责少数民族科技骨干特殊培养工作的政策制定和计划协调工作。

承担培养任务的中央部委所属院校在主管部门的领导下，根据国家下达的年度招生计划，负责考生报名、考试和招生录取工作。

负责博士、硕士阶段的常规管理、教学和毕业生派遣工作；对基础强化培训基地教学、管理等提出建议。基础强化培训基地负责基础强化培训阶段的管理、教学和结业考核等项工作。