小便有点疼可能的原因如下：

1、泌尿道感染。当发生感染后会出现尿路刺激症状，而表现为尿频、尿急伴有腰痛，同时可能伴有腰痛、尿不尽感等，需要进行尿常规检查和尿培养检查来进一步确诊。

2、如果存在有泌尿道结石，如尿道膀胱结石、输尿管结石等也可以产生排尿时疼痛，尤其是尿道结石可以产生尿道内持续疼痛伴有排尿异常，需要进行泌尿系统B超和尿道镜检查来进一步确诊。

3、当患有尿道肿瘤时也可以出现小便疼痛，同时可伴有泌尿系统的出血，表现为肉眼血尿或者尿道口滴血，需要进行尿道镜检查来进一步的确诊。

4、尿道的损伤也可以出现疼痛，患者都有明确的外伤史，如打击、撞击或者高处坠落等。