支付运输费用时，应依据不同的经济活动性质，选择合适的会计科目进行记录。如果运输费用是在销售商品的过程中产生的，那么应将其计入销售成本，记账凭证如下：

借：销售费用

贷：银行存款

而如果运输费用是由于购买固定资产而产生的，则应将其计入固定资产的成本，记账凭证如下：

借：固定资产

贷：银行存款

对于那些符合资本化条件的运输费用支出，例如用于在建工程的运输费用，应当将其资本化，计入在建工程的成本，记账凭证如下：

借：在建工程

贷：银行存款

在具体操作中，需要根据企业的实际业务情况，选择合适的会计科目进行账务处理。此外，每笔运输费用支出的记账凭证应当详细记录运输费用的发生日期、金额、运输方式、运输单位等信息，以备审计和税务检查。

值得注意的是，运输费用的资本化条件应当符合相关会计准则的规定。例如，根据《企业会计准则第4号——固定资产》的规定，企业发生的与固定资产相关的运输费用，如果与固定资产的购建直接相关，并且符合固定资产确认条件的，应当计入固定资产的成本。否则，应计入当期损益。

在日常账务处理过程中，企业应当加强内部控制，确保运输费用支出的真实性和合法性。例如，可以要求供应商提供运输费用发票，并对运输费用发票的真实性进行审核。同时，企业应当建立健全的运输费用管理制度，确保运输费用的合理使用和合规管理。

综上所述，支付运输费用时，需要根据不同的业务性质，选择合适的会计科目进行记账，并确保运输费用支出的真实性和合法性。企业在日常账务处理过程中，应当加强内部控制，建立健全的运输费用管理制度，确保运输费用的合理使用和合规管理。