赣州市林业局直属单位包括林业职工培训中心、种苗站、森防站、推广站、林政管理稽查支队、森工局以及森林公安局和林业调查规划研究院。各直属单位职责如下：

林业职工培训中心负责全市木材运输证的管理和发放，监督出省木材运输办证点和省内木材运输证点的运营，以及管理市林业局驻市行政服务中心工作。

种苗站执行国家有关林木种苗管理法律、法规和规章，规划全市林木种苗发展，管理种苗生产、经营许可证，监督种苗生产、经营活动，保护和管理林木种质资源及植物新品种，选育、引进、试验、登记林木品种，并指导国有林场改革和森林公园建设。

森防站执行森林病虫害防治、检疫法律法规，规划全市森林病虫害防治、检疫工作，为林业发展提供保障。

推广站执行国家有关林业技术推广的法律、法规、方针和政策，规划林业技术推广，引进林业先进技术及科研成果，承担林业科技项目的研究、示范推广，推广林业科技成果、新技术，服务“三农”，宣传林业实用技术及科普知识，指导基层林业技术推广体系建设。

林政管理稽查支队负责全市森林资源保护和林业综合行政执法监督，受理和查处林业行政违法案件，管理基层木材检查站。

森工局作为赣州市林业局下属单位，负责全市林业产业行业管理，编制林业产业发展规划，管理全市木竹生产与加工、林产化工、木竹浆造纸、森林资源综合利用，协调工业原料林基地建设，承办相关报批工作，负责财务、统计、林区公路管理、木材检验技术工人的培训和持证上岗管理，管理松香等林化产品。

森林公安局是负责全市森林公安工作的副县级行政机构，实行双重领导管理体制，依法查处森林及野生动植物刑事案件，实施治安管理处罚，代行《森林法》规定的行政处罚案件。

林业调查规划研究院承担全市森林资源调查与动态监测评价，包括森林资源调查与监测、生态公益林资源调查与监测、沙化土地调查与监测、湿地资源调查与监测、野生动植物资源调查与监测、森林资源档案建立与日常管理维护，组织试验和推广森林资源监测先进技术，编制林业发展规划和实施方案，负责全市营造林技术质量监督检查和林业重点生态工程调查、规划等工作。