不一定。阜阳卫校开设的3+2合作项目是指在阜阳卫校就读三年，然后可以选择在卫校继续就读两年本科课程，获得本科学历。因此，在完成阜阳卫校三年的学习后，可以选择转到合作的大学本部继续完成两年的本科课程，也可以选择留在阜阳卫校继续就读两年本科课程，取得本科毕业证书。