函授本科毕业档案保管有以下三种：

一，有单位接收者，应聘成功者，且单位有档案管理权利的，档案可以留到单位里，只要交给人事管理处的工作人员就可以。

二，有单位接收者，但单位无管理档案的权利时，或者是无单位接收者，可以与当地的人才交流中心进行交流，支付一定的费用，他们会帮助保管一段时间。

三，若人才交流市场无法保管，请咨询当地户籍以及档案科看一下自己的档案目前在什么地方，户籍或档案科告诉在哪里，直接把本人的函授的学籍与其他的档案合并并放在一起就可以了。