建议考虑菏泽学院。

菏泽学院是公办的，东昌学院则是独立学院，和山东师范大学历山学院转设的潍坊理工一样属于民办性质。目前，国内公办院校的学费与民办高校的学费是不一样的，菏泽学院的学费相对要低很多。

此外，从学科专业建设看，菏泽学院的应用化学、物理（理论）都是山东省重点学科；机械电子工程、小学教育、生物工程、 生物教育、物理学、财务管理、化学工程与工艺、生物科学、食品科学与工程等专业是省级特色专业。另外两所院校还没有省级重点或特色学科专业。

PS：不过，潍坊理工的办学声誉也不错，专业设置相对贴近市场需要，就业方面也是不错的。如果个人本科毕业不打算读研，则可以考虑潍坊理工。